中国海洋大学期刊社是学校直属业务单位，主要负责编辑、出版、管理中国海洋大学为第一主办单位的学术期刊，现有工作人员20人，其中社长1人，办公室行政人员2人，专职编辑人员17人。

学校最早的学术期刊是1933年创办的《科学丛刊》，之后《文史丛刊》《文史哲》《山东大学学报》等学术期刊相继创办。山东大学迁至济南，山东海洋学院成立后，《山东海洋学院学报》于1959年创刊。作为新中国第一本以海洋科学为特色的高校学报，伴随着学校的发展而发展，伴随着我国海洋科技的进步而进步。经过多年辛勤耕耘，学校目前围绕海洋科学各领域，主办《中国海洋大学学报（自然科学版）》《中国海洋大学学报（社会科学版）》、Journal of Ocean University of China、Marine Life Science & Technology、Geosystems and Geoenvironment、Intelligent Marine Technology and Systems和Marine development等7本期刊。

其中《中国海洋大学学报（自然科学版）》是中国科学技术信息研究所、中国科学院文献情报中心、北京大学图书馆核心期刊；《中国海洋大学学报（社会科学版）》是中国人文社会科学期刊AMI综合评价”核心期刊；Journal of Ocean University of China被SCI收录，为海洋学分区Q3区期刊；Marine Life Science & Technology被SCI收录，为海洋与淡水生物学Q1区期刊；Geosystems and Geoenvironment于2022年创刊，已被Scopus数据库收录；Intelligent Marine Technology and Systems和Marine development于2023年9月底创刊出版。