本中心采用了以学生为主体的开放式实验教学模式。遵循"厚基础、强专业、重创新、促应用"的实验教学新体系，设置四个层次200多个实验项目，其中综合型实验、创新型实验数量占40％以上。中心实验室对本科生的综合型实验和创新型实验进行了全方位开放，学生均在业余时间进行；综合型实验每2人一组，学生在教师指导下提前查阅资料并撰写出实验方案和具体实验方法，提交给中心网站后，中心再根据实验内容和研究方向研究分发给主讲责任教授，经实验课程教学小组审议通过后，中心主任再根据每个课程接受的实验数量和工作量大小适当进行人员调配，然后开放教学实验室让学生在教师的指导下开始实验。综合型实验强化了学生的自主学习能力、综合实验技能、团结合作精神及科学素质的培养。创新型实验每2-4人一组，学生根据研究兴趣先联系指导教师，然后通过中心网站提前申请、提交实验方案和具体实验方法，中心根据实验内容和研究方向研究分发给主讲责任教授，经实验课程教学小组审议通过后，中心主任再根据每个课程接受的实验数量和工作量大小适当进行人员调配，然后开放教学实验室让学生在教师指导下开始实验。创新型实验强化了学生的自主学习能力、探索精神、课题申请能力、综合实验技能、团结合作精神、学生发现问题、分析问题和解决问题能力以及科学素质的培养。实验技能应用训练，每5-10人一组，中心统一组织，需要学生提前申请，经批准后，中心组织学生到重点实验室、教师科研实验室、"东方红2号"海洋综合调查船、教学科研基地等科研场所进行科研实习，该项训练强化了学生实验技能的应用能力和生产实践能力。

　　中心实验室对实验教学的全方位开放，不仅提高了学生的学习兴趣，使学生在完成基本实验的基础上强化了综合实验技能、创新实验技能和科研项目的自主设计能力，培养了他们的创新能力和科学素质，而且也提高了仪器设备的利用率，大幅度增加了教师和学生之间的交流与互动，学生们的积极性极高。

　　中心在对外开放时，建立了一系列开放管理细则，如进入实验室的人员必须提交实验室开放申请书、签署安全卫生协议书、签署实验器材借用损坏丢失赔偿协议书、填写物品领用登记簿、遵守开放实验成果管理规定等。中心开放机制的运行，不仅调动了学生参加实验的积极性，培养了他们自主学习、研究型学习的能力，也培养了他们的科研技能、创新能力和科学素质，激发了他们从事海洋水产事业的热情，同时也大幅度提高了中心资源的利用率，实现了对外服务。