Ras 超家族是真核生物中最大的信号传导家族，负责将细胞外信号传递到细胞，包括Ras, Rho, Ran, Sar/Arf and Rab 五个家族。Rho GTPases 家族是Ras 超家族中重要组成成员，主要参与信号传导，细胞骨架构建，细胞周期调控，细胞转化，促生长和抗凋亡，先天性免疫调节和基因表达调控等生物学进程。本研究筛查了虾夷扇贝（Patinopecten yessoensis）、栉孔扇贝（Chlamys farreri）和太平洋牡蛎（Crassostrea gigas）的基因组和转录组序列，共鉴定了30个Rho基因，其中虾夷扇贝、栉孔扇贝和太平洋牡蛎基因组中分别含有9个，9个和12个Rho基因，并进一步分析了这些基因的序列结构，进化方式及表达模式。

双壳类Rho家族成员具有Rho蛋白家族的特征结构域，具有较高的序列保守性和功能域相似性。进化分析和种间比较显示，双壳类基因组中含有无脊椎动物中最完善的Rho基因家族成员，包括Rho，Rac，Mig，Cdc42，Tc10，Rnd，RhoU，RhoBTB 和 Miro。RNA-seq数据分析显示，虾夷扇贝和栉孔扇贝Rho基因的表达模式相似，而与太平洋牡蛎相差较多。并且，基因Rho, Rac and Cdc42在太平洋牡蛎基因组中发生了扩张，分别有两个拷贝，而在扇贝基因组中分别只有一个拷贝；扩张基因的基因结构、蛋白结构多有结构缺失或序列突变；相对于其原始基因型，扩张基因的同义突变率Ks（synonymous substitution rates）越大，相对应表达差异越大。本研究是首次在双壳纲中对整个Rho家族系统的鉴定和分析，研究成果丰富了对海洋双壳类Rho家族成员的认识，为深入研究Rho家族在无脊椎中的进化模式，及其在海洋双壳类中的功能奠定了基础。

Reference: Xue Li, Ruijia Wang, Xiaogang Xun, Wenqian Jiao, Mengran Zhang, Shuyue Wang, Shi Wang, Lingling Zhang, Xiaoting Huang, Xiaoli Hu, Zhenmin Bao. The Rho GTPase Family Genes in Bivalvia Genomes: Sequence, Evolution and Expression Analysis. PLoS ONE. 2015 Dec 3;10(12):e0143932. doi: 10.1371/journal.pone.0143932.