在大量的遗传学和基因组学研究中，遗传图谱作为不可或缺的工具起着至关重要的作用。随着基因分型（genotyping-by-sequencing，GBS）技术的发展，对越来越多的非模式生物而言，高密度遗传连锁图谱的构建已变得不再遥不可及。在本研究中，课题组使用2b-RAD（2b-restriction site-associated DNA）技术，首次完成了仿刺参高密度、高分辨率遗传连锁图谱的构建并发表于Nature出版集团旗下的综合性科学SCI期刊Scientific Reports上，该图谱也是目前已知的整个棘皮动物中标记密度最高的遗传连锁图谱。经过多步生物信息学分析后，最终共计7839个SNP位点被成功的定位到仿刺参遗传连锁图谱上，图谱总长度为3706.6 cM，包含22个连锁群，标记间的平均间隔为0.47 cM。图谱覆盖率99.57%。在该遗传连锁图谱的基础上，我们对仿刺参生长相关性状进行了后续的连锁分析，并在5号连锁群79.63-80.01 cM区间内定位到了一个LOD值高于相应阈值（LOD≥12.3）的QTL区间，此QTL区间包含了3个与仿刺参生长性状呈显著相关的SNP位点及一个与海参细胞增殖息息相关的调控基因(RBBP5)，共计可以解释19.8%的仿刺参作图个体的生长性状表型差异。本研究中构建的遗传连锁图谱对后续仿刺参重要经济性状的大规模QTL定位、分子标记辅助育种（MAS）和仿刺参全基因组的拼接和组装提供了宝贵的资源和工具。

Reference:

Meilin Tian, Yangping Li, Jing Jing, Chuang Mu, Huixia Du, Jinzhuang Dou, Junxia Mao, Xue Li, Wenqian Jiao, Yangfan Wang, Xiaoli Hu, Shi Wang, Ruijia Wang and Zhenmin Bao. Construction of a High-Density Genetic Map and Quantitative Trait Locus Mapping in the Sea Cucumber Apostichopus japonicus. Scientific Reports 5, 14852, doi:10.1038/srep14852