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皱纹盘鲍SNP标记开发文章发表于Conservation Genetics Resources
发布人:郭垒  发布时间:2015-09-30   动态浏览次数:297

皱纹盘鲍(Haliotis discus hannai)SNP标记的开发主要基于EST序列,但现阶段,公共数据库中EST序列非常有限。开发SNP标记对群体遗传研究及遗传育种的发展有重要的意义。本研究从皱纹盘鲍基因组序列中筛查并开发了49个SNP标记,并应用这些标记对青岛、大连和荣成群体进行了群体遗传结构分析。结果显示,这三个群体的平均观测杂合度分别为0.356、0.347、0.318,平均期望杂合度分别为0.345、0.338、0.309。只有一个位点在青岛群体中显著偏离哈温平衡(α<0.05, P<0.001)。总体上,荣成群体有较低的遗传多样性,并且与青岛和大连群体有显著的遗传分化(P<0.05)。本研究是迄今为止已发表的数量最多的一组皱纹盘鲍SNP标记,这些标记为以后的群体遗传研究、选择育种及种质资源保护有重要的意义。

Reference:

Qian Yu, Yangping Li, Qiang Xing, Xue Li, Liang Zhao, Yangfan Wang, Xiaoli Hu ,Zhenmin Bao Forty-nine SNP markers developed from the genome dataset of Pacific abalone (Haliotis discus hannai) and their application in population genetic analysis[J]. Conservation Genetics Resources, 1-7.

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