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虾夷扇贝类胡萝卜素积累相关基因SCD鉴定、系统发生及差异表达分析文章发表于Gene
发布人:郭垒  发布时间:2015-05-18   动态浏览次数:291

类胡萝卜素是生物体重要的维生素A原和抗氧化剂,在动物中不能从头合成,只能从食物中获得。虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis, Jay, 1857)是我国重要的海水养殖生物,其新品种“海大金贝”,富含类胡萝卜素,为研究海洋动物类胡萝卜素吸收、转运及代谢机制提供了模型材料。本研究在虾夷扇贝中克隆了硬脂酰辅酶A去饱和酶基因(Stearoyl-CoA desaturase,SCD),分析并发现了其在“海大金贝”和普通虾夷扇贝中的时空表达差异。 PySCD含有4个外显子,3个内含子;cDNA全长2559bp,包含990bp 开放阅读框(open reading form,ORF);编码的氨基酸序列具有SCD蛋白特征结构域:4个跨膜结构域和3个组氨酸结构域。在PySCD基因5’侧翼序列发现了固醇类调节因子(Sterol-regulatory element binding protein, SREBP)结合位点、CCAAT识别位点、视黄醛X受体(retinoic acid X receptor, RXR)结合位点等代谢调控元件;在转录起始位点上游5kb附近发现重复单元37bp、重复次数25左右的小卫星序列。 比较“海大金贝”和普通虾夷扇贝的PySCD基因时空表达显示:在面盘幼虫期,“海大金贝”PySCD基因表达量显著高于普通虾夷扇贝,可能在该时期“海大金贝”的脂类代谢水平提高,进而促进其类胡萝卜素的积累;在成体组织,“海大金贝”的消化腺、性腺、闭壳肌中PySCD基因表达量显著高于普通虾夷扇贝,前期研究显示,在这些组织中,“海大金贝”的类胡萝卜素含量显著高于普通虾夷扇贝。上述结果暗示,PySCD基因的高表达可能促进了类胡萝卜素在“海大金贝”的积累,且“海大金贝”的类胡萝卜素积累与脂类代谢可能存在一定的相关性。

Reference:

Xue Li, Xianhui Ning, Jinzhuang Dou, Qian Yu, Shuyue Wang, Lingling Zhang, Shi Wang, Xiaoli Hu, Zhenmin Bao, An SCD gene from the Mollusca and its upregulation in carotenoid-enriched scallops, Gene, Volume 564, Issue 1, 10 June 2015, Pages 101�108, doi:10.1016/j.gene.2015.02.071.

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