1980年  经原国家教委批准，学校设立海洋机械工程专业，随后学校成立海洋工程系（筹建）。

1983年  海洋机械工程本科专业开始招生。

1985年  海岸工程本科专业开始招生。

1988年  海洋机械工程专业更名为机械设计及制造专业，海岸工程专业更名为港口及航道工程专业。

1989年  工业自动化专科专业开始招生。

1990年  工业与民用建筑专科专业开始招生。

1991年  工业自动化本科专业开始招生。

1993年  工程学院成立，下设机电工程系、土木工程系、海洋工程动力教研室、实验室和海岸工程研究所；港口及航道工程专业更名为港口航道及治河工程专业；房地产管理专科专业开始招生。

1994年  建筑工程本科专业开始招生。

1995年  港口、海岸及近海工程硕士点获批。

1998年  工程学院由鱼山校区迁至浮山校区；港口、海岸及近海工程博士点获批；机械设计及制造、工业自动化、港口航道及治河工程、建筑工程四个本科专业分别更名为机械设计制造及其自动化、自动化、港口航道与海岸工程、土木工程。

2000年  工程热物理、防灾减灾工程及防护工程硕士点获批。

2003年  水利工程博士后流动站获批；控制理论与控制工程、水力学与河流动力学、管理科学与工程硕士学位点获批。增设船舶与海洋工程、工业设计和工程管理三个本科专业。

2005年  水利工程一级学科硕士点获批；设立新的海洋工程系，下设港口航道与海岸工程、船舶与海洋工程两个专业。

2006年  工程学院由浮山校区迁至崂山校区；水文学及水资源、水工结构工程、水利水电工程和机械电子工程硕士点获批；设立自动化系，下设自动化本科专业。

2007年  港口、海岸及近海工程获批国家重点学科（培育）。

2008年  山东省海洋工程重点实验室获批；自动化系更名为自动化及测控系；港口航道与海岸工程批准为国家级特色专业。

2011年  机械工程、控制科学与工程、土木工程一级学科硕士点获批。

2012年  港口航道与海岸工程、机械设计制造及其自动化两个专业入选教育部“卓越工程师教育培养计划”。

2015年  轮机工程本科专业开始招生

2017年  水利工程一级学科博士点获批；船舶与海洋工程一级学科硕士点获批；李华军教授当选中国工程院院士。