王玮

主要研究方向及成果：

王玮课题组致力于从全转录组的尺度上诠释基因调控网络在器官构建过程中的调控机制。生物体器官的正常构建有赖于胚胎发育过程中相关调控基因表达在时空和空间尺度上的精确调控。先天性心脏发育异常 (congenital heart defect，CHD)是新生儿出生时的高发病例，每年不同程度影响多达约1%的新生儿。课题组以海洋模式动物海鞘为模型，综合运用细胞分离纯化，高通量单细胞测序，细胞谱系追踪以及生物信息学分析等技术手段，力求系统性阐明心脏发育过程中的分子调控机制，为预防以及治疗先天性心脏发育异常提供理论支撑。

王玮教授为主要研究人员承担多项由NIH/NHLBI，NIH/NICHD 以及Leducq Foundation – Trans-Atlantic Network of Excellence 资助的重大研究攻关项目，研究成果发表于Nature Cell Biology，PLOS Biology，Developmental Cell，Nature Communication，eLife，Developmenal Biology， PLOS Computational Biology，Current Topics in Developmental Biology， Advances in Experimental Medicine and Biology，Frontiers in Cell and Developmental Biology等期刊。

单细胞测序勾画心脏发育调控机制

在脊椎动物心脏发育过程中，心肌和头部鳃节肌（branchiomeric head muscles）共同起源于位于咽中胚层（pharyngeal mesoderm）中的多能前体细胞群（multipotent progenitors）。但由多能前体细胞分化为心脏中的多种功能细胞的转录调控机制仍有待系统性解析。

王玮教授应用单细胞测序技术，以海鞘作为模式动物，分别构建了心肌（first and second heart lineages）和咽肌（pharyngeal muscle）前体的分化轨迹（developmental trajectories)，并从转录组尺度揭示了这一早期分化过程中的调控机制。

 在这一研究的基础上，本课题组将进一步探讨心脏发育过程中的几个关键问题，包括：1）The First Heart Field (FHF) & Second Heart Field (SHF) 中前体细胞的多样性。2）各类前体细胞与成熟心脏中多种功能性细胞之间的发育关联。3）动态转录组以及染色质结构（chromatin architecture）在前体细胞命运决定中的调控机制。

 课题组诚邀优秀科研人员加盟并欢迎广大同学报考硕、博研究生。

代表性文章：

共同一作：#；通讯作者：*

1. K Kim, S Gibboney, F Razy-Krajka, EK Lowe, W Wang, A Stolfi^*. Regulation of Neurogenesis by FGF Signaling and Neurogenin in the Invertebrate Chordate Ciona. Frontiers in Cell and Developmental Biology 2020 Jun 23; 8:477.

2. W Wang^#, X Niu^#, T Stuart, E Jullian, W Mauck, RG Kelly, R Satija, L Christiaen^*. A single cell transcriptional roadmap for cardiopharyngeal fate diversification. Nature Cell Biology 2019 Jun;21(6):674-686. 

3. N Kaplan, W Wang, L Christiaen^*. Initial characterization of Wnt-Tcf functions during Ciona heart development. Developmental Biology 2019 Apr 15; 448(2):199-209.

4. YY Bernadskaya, S Brahmbhatt, SE Gline, W Wang, L Christiaen^*. Discoidin domain receptor coordinates cell-matrix adhesion and collective polarity in migratory cardiopharyngeal progenitors. Nature Communication 2019 Jan 4;10(1): 1-15.

5. R Athanasiadou^*, B Neymotin, N Brandt, W Wang, L Christiaen, D Gresham, D Tranchina^*. A Complete Statistical Model for Calibration of RNA-seq Counts using External Spike-ins and Maximum Likelihood Theory. PLOS Computational Biology 2019 Mar 11;15(3): e1006794.

6. S Sharma, W Wang, A Stolfi^*. Single-cell transcriptome profiling of the Ciona larval brain. Developmental Biology 2019 Apr 15;448(2):226-236.

7. F Razy-Krajka, B Gravez, N Kaplan, C Racioppi, W Wang, L Christiaen^*. An FGF-driven feed-forward circuit for spatiotemporal patterning of the cardiopharyngeal mesoderm in a simple chordate. eLife 2018 Feb 6;7. pii: e29656.

8. W Wang^#, C Racioppi^#, B Gravez^#, L Christiaen^*. Purification of Fluorescent Labelled Cells from Dissociated Ciona Embryos. Transgenic Techniques in Ascidians. Advances in Experimental Medicine and Biology 2018; 1029:101-107.

9. W Wang, Q Zhang, D Guo^*. An Artemisia WD40-Repeat Gene Regulates Multiple Cellular Functions in Arabidopsis. Journal of Biosciences and Medicines 2016, 4, 30-36.

10. F Razy-Krajka, K Lam, W Wang, A Stolfi, M Joly, R Bonneau, L Christiaen^*. Coll ier/OLF/EBF-dependent transcriptional dynamics control pharyngeal muscle specification from primed cardiopharyngeal progenitors. Developmental Cell 2014 May 12;29(3):263-76. 

11. W Wang, F Razy-Krajka, E Siu, A Ketcham, L Christiaen^*. NK4 antagonizes Tbx1/10 to promote cardiac versus pharyngeal muscle fate in the ascidian second heart field. PLOS Biology 2013;11 (12), e1001725.

12. W Wang, L Christiaen^*. Transcriptional enhancers in ascidian development. Current Topics in Developmental Biology 2012; 98:147–72.  

13. W Wu, M Yuan, Q Zhang, Y Zhu, L Yong, W Wang, Y Qi, D Guo^*. Chemotype-dependent Metabolic Response to Methyl Jasmonate Elicitation in Artemisia annua. Planta Medica 2011; 77 (10), 1048-1053

14. W Wang^#, Y Wang^#, Q Zhang, Y Qi, D Guo^*. Global characterization of Artemisia annua glandular trichome transcriptome using 454 pyrosequencing. BMC Genomics 2009; 10 (1), 465. 

科研项目及资金资助：

2021- 2026 方宗熙-萨斯海洋分子生物学研究中心课题组启动及运行支持； “以海鞘为模式动物研究心脏发育转录调控机制”（本项2021年年度预算为120万元）。