1929年6月，南京国民政府收用私立青岛大学、省立山东大学校舍校产，批准成立国立青岛大学。1930年4月，任命清华大学教授、文学院院长杨振声为校长。杨振声采取“兼容并包，民主办学”的方针，广聘知名专家、学者来校任教。在学科建设上，杨振声提出渐次设立海边生物学、海洋学、气象学等与海洋有关的学科，并在生物学系重点发展海边生物学，此为中国海洋大学特色学科的第一个源头。
这一时期的学科设置为：1930年，文学院设有中国文学系、外国文学系、教育学系；理学院设有数学系、物理学系、化学系、生物学系。1931年将教育学系扩充为教育学院，下辖教育行政系、乡村教育系。
